宇宙都是随时随地在运转，月亮绕着地球转，地球绕着太阳转，太阳绕着银河系转。人体也一样，修药师禅定时，“心法意密”药师琉璃光跟着“息法口密”药师咒与呼吸转，“息法口密”药师咒语呼吸绕着“色法身密”中气脉八大穴位转，这样身口意三密相应于融合修持，禅修者与药师佛互相感应，得药师佛加持。

这样禅修最简单利益是身心得药师佛加持后健康喜悦，大的利益是能得生起次第与圆满次第。

在修药师禅中，得药师佛加持，引发意识潜能而达到超然物外的境界，起初由意识的一念专心而作的持咒观想开始，再渐渐地转变成固有定力，构成自我超越现实而进入药师佛愿海世界，这就是生起次第，也被称为观想次第。

在这观想次第中，经常修习药师禅定，再结合白天、睡中与梦中三个时刻随时随地与药师佛相印，达到清除世俗烦恼增长智慧目的，这样开发定通后，就会产生类似各种神通功能，最简单的神通是你能给别人治病，包括你念药师咒水治病特别灵验，也能在定中观察到将来要发生的如是遇缘结果的事，药师禅定观想次第再修下去就得圆满次第了，圆满次第成就即是解脱生死轮回，也是药师佛第一大愿上讲“如我无异”——即与药师佛相印无差别，众生与药师佛相融一体。

修习药师禅定不能三天捕鱼两天晒网，可以每天修习，但不必固定多少时间来禅修，修持次数当然越多越好！药师禅定刚开始比较困难，又要持诵药师灌顶真言，又要观想药师如来琉璃光，还得照顾呼吸气脉，而且是要金刚念诵，但当你熟练修习药师禅定时，你就开始境随心欲了，一般凡夫是心随转境，但若药师法门与药师禅定修好，你身心所发出正能量能把你过去世所造负能量消融化解掉，那药师法门修习者就能随心所欲。

药师禅定还有几种简单姿势，我常用的方法是把手放在膝盖上。因为打坐时我们的膝盖容易受寒气侵入。如果经常跪拜的人就没事，因为经常去锻炼它，膝盖经脉通顺，皮也厚了，否则这个部位非常容易受寒，因为没有肌肉，不像我们臀部不会受寒，因为那里脂肪丰富。我们打坐时手掌的热气可以保护膝盖，以免受寒。

还有一种方式，我们将手掌朝上放，接受药师佛的能量、磁场感应；另一种，就像平常打坐结药师佛法界定印，这个比较简单。

然后就一直默念，刚开始没经验就用嘴出声念，习惯了就用舌头念，那就不会出声，一点声音都没有，念到后来就不用念了，因为其实我们全身都在念了，不是说观想在喉咙或哪里念，而是念到无念而念。

念诵药师咒治病的时候最好是全身心放松，能盘腿最好，因为我们盘腿容易聚气，气不会散。躺着念也可以，但是躺着气容易散掉，范围太大，坐着小一点，还是盘腿最好。

修药师禅定最好持八关斋戒。药师禅定可以为我们治病，但是我们要一直用功，因为我们的磁场和药师佛感应时，就不容易得病，还能健身，冤亲债主想捣乱一下也无从下手。