南京南站可以在站内换乘，下车后从站台直接到候车室。一般来说，第一趟车之前会提前取两趟车的票。第一趟列车到站后，坐直梯或者直接走楼梯，就是换乘通道。持两张火车票进入候车大厅即可换乘。

不同类型的换乘方式同平台换乘：同平台换乘是最便捷的换乘方式。下车后，乘客可以在同一个站台换车，等待另一条线路的列车到站。

节点转移：适用于十字型线和T型线。在建造过程中，通道的连接部分以集成的方式设计。换乘时，要求乘客下车，使用楼梯或自动扶梯到达另一层的站台。

通道换乘：常见于两站台距离较远的车站。下车后，乘客要经过专用通道，走一段距离，然后在另一条线路的站台换车。通常，他们需要中途换楼层。